Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SP140Q13342 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP140Q13342 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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SP140Q13342 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP140Q13342 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP140Q13342 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP140Q13342 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP140Q13342 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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