Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRSQ13332 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms