Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RESTQ13127 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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