Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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