Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TRAF1Q13077 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF1Q13077 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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