Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSTF3Q12996 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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