Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPN13Q12923 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPN13Q12923 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN13Q12923 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPN13Q12923 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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