Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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