Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms