Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC8Q09428 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC8Q09428 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms