Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD300CQ08708 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD300CQ08708 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms