Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms