Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX1T1Q06455 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms