Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME1Q06323 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms