Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms