Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms