Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms