Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms