Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms