Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms