Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms