Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms