Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P62684 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms