Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVS71-1P61550 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms