Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR4P61073 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR4P61073 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms