Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCDC1P59894 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms