Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms