Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CABP4P57796 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABP4P57796 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABP4P57796 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABP4P57796 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms