Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms