Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms