Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms