Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms