Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms