Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms