Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASP4P49662 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms