Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NESP48681 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NESP48681 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NESP48681 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
NESP48681 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NESP48681 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NESP48681 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms