Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRXP46100 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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