Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC1A1P43005 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms