Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTBRP36941 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LTBRP36941 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LTBRP36941 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBRP36941 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBRP36941 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms