Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLT4P35916 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLT4P35916 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLT4P35916 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FLT4P35916 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms