Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN7P35236 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms