Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms