Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRB3P28472 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms