Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PEX2P28328 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX2P28328 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms