Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms