Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMB9P28065 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms