Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms