Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PLNP26678 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PLNP26678 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms