Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA6P23229 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms