Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TCEA1P23193 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms